Juninho está passando por um momento desafiador no Flamengo, onde corre o risco de completar quatro jogos sem ser relacionado para a equipe. O atacante, que foi o primeiro reforço da gestão Bap, perdeu o posto de reserva mais acionado por Filipe Luís, que havia pedido sua contratação no início do ano. Mesmo estando com a delegação do Flamengo em Porto Alegre, ainda não há confirmação de sua presença entre os relacionados para o jogo contra o Inter, pela Libertadores.
Há indícios de que a falta de espaço no time possa levar Juninho a deixar o clube, apesar de não haver propostas concretas no momento. Anteriormente, o jogador chegou a ser alvo de clubes da Arábia Saudita, porém o Flamengo recusou as tentativas de empréstimo. Com a ausência nos últimos jogos, o atacante viu seu posto de reserva ser ocupado por Wallace Yan, que teve a oportunidade de entrar em campo no último confronto do time.
Mesmo tendo tido uma sequência de jogos após a Copa do Mundo de Clubes, Juninho não conseguiu marcar gols ou fornecer assistências nos quatro jogos em que participou. Ele chegou a ser relacionado para enfrentar o Atlético-MG, mas não teve a chance de atuar durante a partida que resultou na eliminação do Flamengo na Copa do Brasil. A última aparição do jogador em campo foi contra o Ceará, quando entrou nos minutos finais em um empate.
No início do ano, Juninho estava com um acerto encaminhado para o Sevilla, da Espanha, mas acabou mudando de ideia e voltando ao Brasil devido a uma proposta do Flamengo, que investiu R$ 37,2 milhões em sua contratação. Agora, o atacante vive a incerteza de seu futuro no clube diante da falta de oportunidades em campo. A história de Juninho no Flamengo segue em aberto, com a possibilidade de uma saída em um futuro próximo.